La Biblioteca de la Universidad del Cauca se organiza a partir del Decreto del 6 de Octubre de 1827 impartido por el Libertador Presidente, el cual asigna bienes y capitales a la Universidad, mediante este Decreto las colecciones de los extintos conventos de San Francisco y Santo Domingo (obras en su mayoría de carácter filosófico y religioso), mas los folletos y libros editados en la imprenta adquirida por la Universidad y la asignación de $ 500 anuales para compra de obras científicas, son la base de su conformación. Su primer bibliotecario fué Don José Manuel Mosquera.